La falta de combustible parece confirmarse como causa del accidente.
La declaración de un piloto de Avianca que estaba también en aproximación al aeropuerto de Medellín demuestra que el vuelo de Lamia con el equipo de fútbol brasileño Chapecoense se quedó sin combustible cuando estaba en aproximación y ello causó que también se quedase sin electricidad dado que los generadores de esta están en los motores, y al pararse estos dejaron de funcionar.
Según este piloto, cuando ambos aviones, el suyo y el de Lamia estaban en aproximación un tercer avión, de Viva Colombia, declaró emergencia por una pérdida de combustible. Tanto al Avianca como al Lamia se les dio instrucciones para hacer una espera mientras aterrizaba el otro avión. El Avianca a 19.000 pies y el Lamia por encima. En ese momento los pilotos de Lamia solicitaron prioridad para aterrizar por falta de combustible pero sin declarar emergencia. 
La controladora, según el piloto de Avianca, les informó que el avión de Viva Colombia estaba aterrizando y que tenían que esperar. Sin embargo, los pilotos de Lamia “se lanzaron” hacia el aeropuerto repitiendo que tenían problemas de combustible. Según la traza del vuelo en Flightradar apenas completaron un circuito y medio de espera antes de iniciar ese descenso final. Según descendía ya declararon emergencia por combustible y en ese momento la controladora desvió al Avianca de la trayectoria del RJ-85.
Al pedir la controladora más información sobre el problema, el copiloto anunció un fallo total eléctrico y comenzó a pedir vectores para la pista y ayuda. La controladora les dio información sobre su posición y altura. Según el piloto de Avianca esos datos les situaban peligrosamente cerca de las montañas. Instantes antes se cortaron las llamadas desde el Lamia. En total unos dos minutos.
76 de los 81 ocupantes del avión fallecieron al chocar el avión matrícula CP-2933 contra el cerro El Gordo a unos 15.000 ft sobre el nivel del mar y unos 50 km del aeropuerto. El avión había partido del aeropuerto Viru Viru (Santa Cruz de la Sierra).
